Агентство является государственным органом, непосредственно подчиненным и подотчетным Президенту Республики Казахстан, осуществляющим: 1) руководство в сфере государственной службы и оказания государственных услуг; 2) в пределах, предусмотренных законодательством Республики Казахстан, руководство и межотраслевую координацию и иные специальные исполнительные и разрешительные функции по предупреждению, выявлению, пресечению, раскрытию и расследованию коррупционных преступлений и правонарушений