Державна Азовська морська екологічна інспекція у межах своїх повноважень забезпечує реалізацію державної політики в галузі охорони навколишнього природного середовища, раціонального використання і відтворення природних ресурсів, забезпечення екологічної безпеки на підконтрольних територіях, а саме: території завширшки сто метрів від урізу води Азовського моря у межах Донецької, Запорізької, Херсонської областей, включаючи стрілки та коси. Крім того, діяльність Держекоінспекції поширюється на три міста - Маріуполь (Донецька область), Бердянськ (Запорізька область) та Генічеськ (Херсонська область) та внутрішні, територіальні води, виключну (морську) економічну зону України, континентальний шельф України та лимани.